Read the Docs build information Build id: 124580 Project: tiledb-inc-tiledb-py Version: latest Commit: 32ce4a32a505ed7c249ee422539852d059a60b1f Date: 2018-07-07T19:37:35.501420Z State: finished Success: True [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:37:36.057150Z, end-time: 2018-07-08T00:37:36.065393Z, duration: 0, exit-code: 0 git remote set-url origin https://github.com/TileDB-Inc/TileDB-Py.git [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:37:36.123399Z, end-time: 2018-07-08T00:37:36.538080Z, duration: 0, exit-code: 0 git fetch --tags --prune From https://github.com/TileDB-Inc/TileDB-Py x [deleted] (none) -> origin/ttd/quickstart_fixes 723ff26..32ce4a3 dev -> origin/dev * [new branch] jcb/subarray -> origin/jcb/subarray 49f0ee2..7425689 sp/examples -> origin/sp/examples * [new branch] ttd/examples -> origin/ttd/examples [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:37:36.601040Z, end-time: 2018-07-08T00:37:36.618869Z, duration: 0, exit-code: 0 git checkout --force origin/dev Previous HEAD position was 723ff26... 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Solving package specifications: . Package plan for installation in environment /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest: The following NEW packages will be INSTALLED: alabaster: 0.7.11-py35_2 conda-forge asn1crypto: 0.24.0-py35_0 conda-forge babel: 2.6.0-py35_0 conda-forge cffi: 1.11.5-py35_0 conda-forge chardet: 3.0.4-py_1 conda-forge cryptography: 2.2.1-py35hdffb7b8_1 conda-forge docutils: 0.14-py35_0 conda-forge freetype: 2.8.1-0 conda-forge idna: 2.7-py35_0 conda-forge imagesize: 1.0.0-py35_0 conda-forge jinja2: 2.10-py35_0 conda-forge jpeg: 9c-h470a237_0 conda-forge libffi: 3.2.1-3 conda-forge libpng: 1.6.34-ha92aebf_1 conda-forge libtiff: 4.0.9-he6b73bb_1 conda-forge markupsafe: 1.0-py35_0 conda-forge mock: 2.0.0-py35_0 conda-forge olefile: 0.45.1-py_1 conda-forge packaging: 17.1-py_0 conda-forge pbr: 4.1.0-py_0 conda-forge pillow: 5.2.0-py35_0 conda-forge pycparser: 2.18-py35_0 conda-forge pygments: 2.2.0-py35_0 conda-forge pyopenssl: 18.0.0-py35_0 conda-forge pyparsing: 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end-time: 2018-07-08T00:39:43.589300Z, duration: 2, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin/pip install -U --cache-dir /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/.cache/pip recommonmark readthedocs-sphinx-ext Collecting recommonmark Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/df/a5/8ee4b84af7f997dfdba71254a88008cfc19c49df98983c9a4919e798f8ce/recommonmark-0.4.0-py2.py3-none-any.whl Collecting readthedocs-sphinx-ext Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/f7/56/030e46adb75fb8ce3ffa32e95e6b9164c143e8f001f5e75295485f93c7d0/readthedocs_sphinx_ext-0.5.13-py2.py3-none-any.whl Requirement already up-to-date: docutils>=0.11 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from recommonmark) Collecting commonmark<=0.5.4 (from recommonmark) Requirement already up-to-date: requests in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: chardet<3.1.0,>=3.0.2 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: idna<2.8,>=2.5 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: urllib3<1.24,>=1.21.1 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: certifi>=2017.4.17 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Installing collected packages: commonmark, recommonmark, readthedocs-sphinx-ext Successfully installed commonmark-0.5.4 readthedocs-sphinx-ext-0.5.13 recommonmark-0.4.0 You are using pip version 9.0.3, however version 10.0.1 is available. You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command. [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:39:43.644306Z, end-time: 2018-07-08T00:40:19.583986Z, duration: 35, exit-code: 0 python setup.py install --force running install running bdist_egg GNU Make 4.1 Built for x86_64-pc-linux-gnu Copyright (C) 1988-2014 Free Software Foundation, Inc. License GPLv3+: GNU GPL version 3 or later This is free software: you are free to change and redistribute it. There is NO WARRANTY, to the extent permitted by law. -- Starting TileDB superbuild. -- searching for catch in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/build/externals/src -- Found Zlib: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/libz.so -- Found OpenSSL: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libssl.so /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcrypto.so -- Found Curl: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/libcurl.so -- TARGET_ARCH not specified; inferring host OS to be platform compilation target -- Building AWS libraries as static objects -- Generating linux build config -- Building project version: 0.1.1 -- Found AWS SDK for C++, Version: 0.1.1, Install Root:/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/build/externals/install, Platform Prefix:, Platform Dependent Libraries: pthread;ssl;z;curl -- Found AWS lib: aws-cpp-sdk-s3 -- Found AWS lib: aws-cpp-sdk-core -- Could NOT find TBB (missing: TBB_LIBRARIES TBB_INCLUDE_DIR) -- Adding TBB as an external project -- Not found clang-tidy -- Not found clang-format -- Install prefix is /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist -- Configuring done -- Generating done -- Build files have been written to: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/build [ 50%] Built target ep_tbb [100%] Built target tiledb Scanning dependencies of target TILEDB_CORE_OBJECTS [ 0%] Building CXX object tiledb/CMakeFiles/TILEDB_CORE_OBJECTS.dir/sm/global_state/openssl_state.cc.o [ 4%] Building CXX object tiledb/CMakeFiles/TILEDB_CORE_OBJECTS.dir/sm/misc/uuid.cc.o [ 96%] Built target TILEDB_CORE_OBJECTS [100%] Linking CXX shared library libtiledb.so [100%] Built target tiledb_shared Install the project... -- Install configuration: "Release" -- Installing: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/libtiledb.so -- Set runtime path of "/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/libtiledb.so" to "/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib" -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/tiledb.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/tiledb_enum.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/tiledb_version.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/tiledb -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/array.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/array_schema.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/attribute.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/compressor.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/config.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/context.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/core_interface.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/deleter.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/dimension.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/domain.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/exception.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/group.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/map.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/map_schema.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/object.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/object_iter.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/query.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/schema_base.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/stats.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/type.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/utils.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/version.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/vfs.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include/tiledb/tiledb_export.h -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/cmake/TileDB/TileDBConfig.cmake -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/cmake/TileDB/TileDBTargets.cmake -- Up-to-date: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/cmake/TileDB/TileDBTargets-release.cmake Building libtiledb in directory /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/build... Copying file /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib/libtiledb.so to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/tiledb/native/libtiledb.so running egg_info writing dependency_links to tiledb.egg-info/dependency_links.txt writing tiledb.egg-info/PKG-INFO writing top-level names to tiledb.egg-info/top_level.txt writing requirements to tiledb.egg-info/requires.txt reading manifest template 'MANIFEST.in' writing manifest file 'tiledb.egg-info/SOURCES.txt' installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg running install_lib running build_py copying tiledb/version.py -> build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb copying tiledb/tests/test_libtiledb.py -> build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/tests copying tiledb/native/libtiledb.so -> build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/native running build_ext cythoning tiledb/libtiledb.pyx to tiledb/libtiledb.cpp building 'tiledb.libtiledb' extension gcc -pthread -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/include -I/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg/numpy/core/include -I/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/include/python3.5m -c tiledb/libtiledb.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.5/tiledb/libtiledb.o -std=c++11 cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++ [enabled by default] In file included from /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1821:0, from /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:18, from /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4, from tiledb/libtiledb.cpp:584: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp] #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \ ^ g++ -pthread -shared -L/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib -Wl,-rpath=/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib,--no-as-needed build/temp.linux-x86_64-3.5/tiledb/libtiledb.o -L/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/build/TileDB-dev/dist/lib -L/home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib -ltiledb -lpython3.5m -o build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/libtiledb.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so creating build/bdist.linux-x86_64/egg creating build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/libtiledb.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/version.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb creating build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/tests/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/tests/all.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/tests/test_libtiledb.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/tests/common.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests creating build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/native copying build/lib.linux-x86_64-3.5/tiledb/native/libtiledb.so -> build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/native byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/__init__.py to __init__.cpython-35.pyc byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/version.py to version.cpython-35.pyc byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests/__init__.py to __init__.cpython-35.pyc byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests/all.py to all.cpython-35.pyc byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests/test_libtiledb.py to test_libtiledb.cpython-35.pyc byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/tests/common.py to common.cpython-35.pyc creating stub loader for tiledb/libtiledb.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/tiledb/libtiledb.py to libtiledb.cpython-35.pyc creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO copying tiledb.egg-info/PKG-INFO -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO copying tiledb.egg-info/SOURCES.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO copying tiledb.egg-info/dependency_links.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO copying tiledb.egg-info/requires.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO copying tiledb.egg-info/top_level.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO writing build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO/native_libs.txt zip_safe flag not set; analyzing archive contents... tiledb.__pycache__.__init__.cpython-35: module references __file__ tiledb.__pycache__.libtiledb.cpython-35: module references __file__ tiledb.tests.__pycache__.all.cpython-35: module references __file__ creating 'dist/tiledb-0.1.2.dev24-py3.5-linux-x86_64.egg' and adding 'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it) Processing tiledb-0.1.2.dev24-py3.5-linux-x86_64.egg creating /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages/tiledb-0.1.2.dev24-py3.5-linux-x86_64.egg Extracting tiledb-0.1.2.dev24-py3.5-linux-x86_64.egg to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages Adding tiledb 0.1.2.dev24 to easy-install.pth file Installed /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/lib/python3.5/site-packages/tiledb-0.1.2.dev24-py3.5-linux-x86_64.egg Processing dependencies for tiledb==0.1.2.dev24 Searching for numpy==1.15.0rc1 Best match: numpy 1.15.0rc1 Processing numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg Adding numpy 1.15.0rc1 to easy-install.pth file Installing f2py script to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin Installing conv-template script to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin Installing from-template script to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin Installing f2py script to /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin Using /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/checkouts/latest/.eggs/numpy-1.15.0rc1-py3.5-linux-x86_64.egg Finished processing dependencies for tiledb==0.1.2.dev24 [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:40:20.536668Z, end-time: 2018-07-08T00:40:20.609753Z, duration: 0, exit-code: 0 cat doc/source/conf.py #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- # # -- Imports configuration ------------------------------------------------- import os import sys from os.path import abspath, join, dirname sys.path.insert(0, abspath(join(dirname(__file__)))) # -- ReadTheDocs configuration --------------------------------------------- # Special handling on ReadTheDocs builds. # Some of this code is from https://github.com/robotpy/robotpy-docs/blob/master/conf.py readthedocs = os.environ.get('READTHEDOCS', None) == 'True' rtd_version = os.environ.get('READTHEDOCS_VERSION', 'latest') rtd_version = rtd_version if rtd_version in ['stable', 'latest'] else 'stable' # -- Project information ----------------------------------------------------- project = 'TileDB-Py' copyright = '2018, TileDB, Inc.' author = 'TileDB, Inc.' # The short X.Y version version = '0.1' # The full version, including alpha/beta/rc tags release = '0.1.0' # -- General configuration --------------------------------------------------- # If your documentation needs a minimal Sphinx version, state it here. # # needs_sphinx = '1.0' # Add any Sphinx extension module names here, as strings. They can be # extensions coming with Sphinx (named 'sphinx.ext.*') or your custom # ones. extensions = [ 'sphinx.ext.autodoc', 'sphinx.ext.doctest', 'sphinx.ext.intersphinx', ] # Mapping for linking between RTD subprojects. if readthedocs: intersphinx_mapping = { 'tiledb': ('https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/en/%s/' % rtd_version, None), 'tiledb-py': ('https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/%s/' % rtd_version, None), 'python': ('https://docs.python.org/', None) } # Add any paths that contain templates here, relative to this directory. templates_path = ['_templates'] # The suffix(es) of source filenames. # You can specify multiple suffix as a list of string: # # source_suffix = ['.rst', '.md'] source_suffix = '.rst' # The master toctree document. master_doc = 'index' # The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation # for a list of supported languages. # # This is also used if you do content translation via gettext catalogs. # Usually you set "language" from the command line for these cases. language = None # List of patterns, relative to source directory, that match files and # directories to ignore when looking for source files. # This pattern also affects html_static_path and html_extra_path . exclude_patterns = ['_build', 'Thumbs.db', '.DS_Store'] # The name of the Pygments (syntax highlighting) style to use. pygments_style = 'friendly' # -- Options for HTML output ------------------------------------------------- html_static_path = ['_static'] html_logo = '_static/tileDB_uppercase_600_112.png' html_favicon = '_static/favicon.ico' if readthedocs: html_theme = 'default' else: import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] # -- Options for HTMLHelp output --------------------------------------------- # Output file base name for HTML help builder. htmlhelp_basename = 'TileDB-Pydoc' # -- Options for LaTeX output ------------------------------------------------ latex_elements = { # The paper size ('letterpaper' or 'a4paper'). # # 'papersize': 'letterpaper', # The font size ('10pt', '11pt' or '12pt'). # # 'pointsize': '10pt', # Additional stuff for the LaTeX preamble. # # 'preamble': '', # Latex figure (float) alignment # # 'figure_align': 'htbp', } # Grouping the document tree into LaTeX files. List of tuples # (source start file, target name, title, # author, documentclass [howto, manual, or own class]). latex_documents = [ (master_doc, 'TileDB-Py.tex', 'TileDB-Py Documentation', 'TileDB, Inc.', 'manual'), ] # -- Options for manual page output ------------------------------------------ # One entry per manual page. List of tuples # (source start file, name, description, authors, manual section). man_pages = [ (master_doc, 'tiledb-py', 'TileDB-Py Documentation', [author], 1) ] # -- Options for Texinfo output ---------------------------------------------- # Grouping the document tree into Texinfo files. List of tuples # (source start file, target name, title, author, # dir menu entry, description, category) texinfo_documents = [ (master_doc, 'TileDB-Py', 'TileDB-Py Documentation', author, 'TileDB-Py', 'One line description of project.', 'Miscellaneous'), ] # -- Custom Document processing ---------------------------------------------- # Generate the sidebar automatically so that it is identical across all subprojects. # This (and gensidebar.py) from https://github.com/robotpy/robotpy-docs import gensidebar gensidebar.generate_sidebar({'on_rtd': readthedocs, 'rtd_version': rtd_version}, 'tiledb-py') # -- Custom setup ----------------------------------------------------------- def setup(app): app.add_stylesheet('custom.css') ########################################################################### # auto-created readthedocs.org specific configuration # ########################################################################### # # The following code was added during an automated build on readthedocs.org # It is auto created and injected for every build. The result is based on the # conf.py.tmpl file found in the readthedocs.org codebase: # https://github.com/rtfd/readthedocs.org/blob/master/readthedocs/doc_builder/templates/doc_builder/conf.py.tmpl # import sys import os.path from six import string_types from sphinx import version_info # Get suffix for proper linking to GitHub # This is deprecated in Sphinx 1.3+, # as each page can have its own suffix if globals().get('source_suffix', False): if isinstance(source_suffix, string_types): SUFFIX = source_suffix else: SUFFIX = source_suffix[0] else: SUFFIX = '.rst' # Add RTD Static Path. Add to the end because it overwrites previous files. if not 'html_static_path' in globals(): html_static_path = [] if os.path.exists('_static'): html_static_path.append('_static') html_static_path.append('/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static') # Add RTD Theme only if they aren't overriding it already using_rtd_theme = False if 'html_theme' in globals(): if html_theme in ['default']: # Allow people to bail with a hack of having an html_style if not 'html_style' in globals(): import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_style = None html_theme_options = {} if 'html_theme_path' in globals(): html_theme_path.append(sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()) else: html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] using_rtd_theme = True else: import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_style = None html_theme_options = {} if 'html_theme_path' in globals(): html_theme_path.append(sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()) else: html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] using_rtd_theme = True if globals().get('websupport2_base_url', False): websupport2_base_url = 'https://readthedocs.com/websupport' if 'http' not in settings.MEDIA_URL: websupport2_static_url = 'https://media.readthedocs.com/' else: websupport2_static_url = 'https://media.readthedocs.com/media//static' #Add project information to the template context. context = { 'using_theme': using_rtd_theme, 'html_theme': html_theme, 'current_version': "latest", 'version_slug': "latest", 'MEDIA_URL': "https://media.readthedocs.com/media/", 'PRODUCTION_DOMAIN': "readthedocs.com", 'versions': [ ("latest", "/en/latest/"), ("stable", "/en/stable/"), ("ttd-project-desc", "/en/ttd-project-desc/"), ], 'downloads': [ ], 'subprojects': [ ], 'slug': 'tiledb-inc-tiledb-py', 'name': u'TileDB-Py', 'rtd_language': u'en', 'programming_language': u'words', 'canonical_url': 'https://docs.tiledb.io/projects/tiledb-py/en/stable/', 'analytics_code': '', 'single_version': False, 'conf_py_path': '/doc/source/', 'api_host': 'https://readthedocs.com', 'github_user': 'TileDB-Inc', 'github_repo': 'TileDB-Py', 'github_version': 'dev', 'display_github': True, 'bitbucket_user': 'None', 'bitbucket_repo': 'None', 'bitbucket_version': 'dev', 'display_bitbucket': False, 'gitlab_user': 'None', 'gitlab_repo': 'None', 'gitlab_version': 'dev', 'display_gitlab': False, 'READTHEDOCS': True, 'using_theme': (html_theme == "default"), 'new_theme': (html_theme == "sphinx_rtd_theme"), 'source_suffix': SUFFIX, 'user_analytics_code': '', 'global_analytics_code': 'UA-17997319-2', 'commit': '32ce4a32', } if 'html_context' in globals(): html_context.update(context) else: html_context = context # Add custom RTD extension if 'extensions' in globals(): # Insert at the beginning because it can interfere # with other extensions. # See https://github.com/rtfd/readthedocs.org/pull/4054 extensions.insert(0, "readthedocs_ext.readthedocs") else: extensions = ["readthedocs_ext.readthedocs"] # Build the json artifacts with the html build step rtd_generate_json_artifacts = False [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:40:20.689657Z, end-time: 2018-07-08T00:40:23.625909Z, duration: 2, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin/sphinx-build -T -E -b readthedocs -d _build/doctrees-readthedocs -D language=en . _build/html Running Sphinx v1.7.5 loading translations [en]... done making output directory... loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/en/latest/objects.inv... loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv... WARNING: failed to reach any of the inventories with the following issues: loading intersphinx inventory from https://docs.python.org/objects.inv... WARNING: intersphinx inventory 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv' not fetchable due to : ('intersphinx inventory %r not fetchable due to %s: %s', 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv', , HTTPError(...)) intersphinx inventory has moved: https://docs.python.org/objects.inv -> https://docs.python.org/3/objects.inv building [mo]: targets for 0 po files that are out of date building [readthedocs]: targets for 2 source files that are out of date updating environment: 2 added, 0 changed, 0 removed reading sources... [ 50%] index reading sources... [100%] python-api docstring of tiledb.Domain:4: WARNING: Inline emphasis start-string without end-string. docstring of tiledb.DenseArray.query:8: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.DenseArray.subarray:9: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.SparseArray.query:8: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.SparseArray.subarray:9: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. looking for now-outdated files... none found pickling environment... done checking consistency... done preparing documents... done writing output... [ 50%] index writing output... [100%] python-api generating indices... genindex writing additional pages... search copying static files... WARNING: html_static_path entry '/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static' does not exist done copying readthedocs static files... done copying searchtools... done copying extra files... done dumping search index in English (code: en) ... done dumping object inventory... done build succeeded, 8 warnings. The HTML pages are in _build/html. [rtd-command-info] start-time: 2018-07-08T00:40:23.721498Z, end-time: 2018-07-08T00:40:26.157586Z, duration: 2, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb-py/conda/latest/bin/sphinx-build -T -b json -d _build/doctrees-json -D language=en . _build/json Running Sphinx v1.7.5 loading translations [en]... done making output directory... loading pickled environment... done loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv... WARNING: failed to reach any of the inventories with the following issues: WARNING: intersphinx inventory 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv' not fetchable due to : ('intersphinx inventory %r not fetchable due to %s: %s', 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv', , HTTPError(...)) building [mo]: targets for 0 po files that are out of date building [json]: targets for 2 source files that are out of date updating environment: 0 added, 1 changed, 0 removed reading sources... [100%] python-api docstring of tiledb.Domain:4: WARNING: Inline emphasis start-string without end-string. docstring of tiledb.DenseArray.query:8: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.DenseArray.subarray:9: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.SparseArray.query:8: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. docstring of tiledb.SparseArray.subarray:9: WARNING: Field list ends without a blank line; unexpected unindent. looking for now-outdated files... none found pickling environment... done checking consistency... done preparing documents... done writing output... [ 50%] index writing output... [100%] python-api generating indices... genindex writing additional pages... search copying static files... WARNING: html_static_path entry '/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static' does not exist done copying extra files... done dumping search index in English (code: en) ... done dumping object inventory... done build succeeded, 8 warnings. You can now process the JSON files in _build/json.