Read the Docs build information Build id: 113267 Project: tiledb-inc-tiledb Version: latest Commit: 7c256a2690a0da5d701d1465d678ed77983c25ef Date: 2018-05-31T21:55:40.389331Z State: finished Success: True [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:55:41.320549Z, end-time: 2018-06-01T02:55:41.328164Z, duration: 0, exit-code: 0 git remote set-url origin https://github.com/TileDB-Inc/TileDB.git [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:55:41.393629Z, end-time: 2018-06-01T02:55:42.264756Z, duration: 0, exit-code: 0 git fetch --tags --prune From https://github.com/TileDB-Inc/TileDB b0e2372..7c256a2 dev -> origin/dev * [new branch] jcb/open_array -> origin/jcb/open_array * [new branch] sp/662 -> origin/sp/662 * [new branch] sp/open_array -> origin/sp/open_array * [new branch] sp/set_buffer -> origin/sp/set_buffer * [new branch] ttd/disable-static-tiledb -> origin/ttd/disable-static-tiledb [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:55:42.352777Z, end-time: 2018-06-01T02:55:42.374231Z, duration: 0, exit-code: 0 git checkout --force origin/dev Previous HEAD position was b0e2372... 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|############################# | Time: 0:Collecting sphinxcontrib-contentui Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/4b/88/90f37e2734402af7d03b323b4aa2ebf81632850d679b3d09268a81e610f6/sphinxcontrib-contentui-0.2.2.tar.gz Requirement already satisfied: Sphinx>=1.0 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: imagesize in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: packaging in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: Jinja2>=2.3 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from 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pyparsing>=2.0.2 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from packaging->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: MarkupSafe>=0.23 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from Jinja2>=2.3->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: chardet<3.1.0,>=3.0.2 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests>=2.0.0->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: idna<2.7,>=2.5 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests>=2.0.0->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: urllib3<1.23,>=1.21.1 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests>=2.0.0->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: certifi>=2017.4.17 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests>=2.0.0->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Requirement already satisfied: pytz>=0a in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from babel!=2.0,>=1.3->Sphinx>=1.0->sphinxcontrib-contentui) Building wheels for collected packages: sphinxcontrib-contentui Running setup.py bdist_wheel for sphinxcontrib-contentui: started Running setup.py bdist_wheel for sphinxcontrib-contentui: finished with status 'done' Stored in directory: /home/docs/.cache/pip/wheels/20/a7/b3/36a777368b30509a9e8921bca72d72333ca83b07d0bad843b0 Successfully built sphinxcontrib-contentui Installing collected 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Solving package specifications: . Package plan for installation in environment /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest: The following NEW packages will be INSTALLED: freetype: 2.8.1-0 conda-forge jpeg: 9b-2 conda-forge libpng: 1.6.34-0 conda-forge libtiff: 4.0.9-0 conda-forge mock: 2.0.0-py36_0 conda-forge olefile: 0.45.1-py36_0 conda-forge pbr: 4.0.3-py_0 conda-forge pillow: 5.1.0-py36_0 conda-forge sphinx_rtd_theme: 0.3.1-py36_0 conda-forge jpeg-9b-2.tar. 0% | | ETA: --:--:-- 0.00 B/s jpeg-9b-2.tar. 1% | | ETA: 0:00:05 204.91 kB/s jpeg-9b-2.tar. 2% | | ETA: 0:00:05 204.70 kB/s jpeg-9b-2.tar. 4% |# | ETA: 0:00:03 306.41 kB/s jpeg-9b-2.tar. 5% |# | ETA: 0:00:03 272.81 kB/s jpeg-9b-2.tar. 7% |## | ETA: 0:00:03 255.54 kB/s jpeg-9b-2.tar. 8% |## | ETA: 0:00:03 306.33 kB/s jpeg-9b-2.tar. 10% |### | ETA: 0:00:03 321.77 kB/s jpeg-9b-2.tar. 11% |### | ETA: 0:00:02 326.93 kB/s jpeg-9b-2.tar. 13% |#### | ETA: 0:00:02 367.49 kB/s jpeg-9b-2.tar. 14% |#### | ETA: 0:00:02 340.68 kB/s 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|############################# | Time: 0:00:00 7.73 MB/s sphinx_rtd_the 96% |############################# | Time: 0:00:00 7.79 MB/s sphinx_rtd_the 97% |############################## | Time: 0:00:00 7.85 MB/s sphinx_rtd_the 98% |############################## | Time: 0:00:00 7.91 MB/s sphinx_rtd_the 99% |############################## | Time: 0:00:00 7.96 MB/s sphinx_rtd_the 99% |############################## | Time: 0:00:00 8.02 MB/s sphinx_rtd_the 100% |###############################| Time: 0:00:00 8.03 MB/s sphinx_rtd_the 100% |###############################| Time: 0:00:00 8.02 MB/s pillow-5.1.0-p 0% | | ETA: --:--:-- 0.00 B/s pillow-5.1.0-p 1% | | Time: 0:00:00 39.58 MB/s pillow-5.1.0-p 3% |# | Time: 0:00:00 48.19 MB/s pillow-5.1.0-p 4% |# | Time: 0:00:00 52.63 MB/s pillow-5.1.0-p 6% |## | Time: 0:00:00 47.25 MB/s pillow-5.1.0-p 8% |## | Time: 0:00:00 34.95 MB/s pillow-5.1.0-p 9% |### | Time: 0:00:00 27.75 MB/s pillow-5.1.0-p 11% |### | Time: 0:00:00 24.19 MB/s pillow-5.1.0-p 12% |#### | Time: 0:00:00 23.58 MB/s pillow-5.1.0-p 14% |#### | Time: 0:00:00 25.38 MB/s pillow-5.1.0-p 16% |##### | Time: 0:00:00 27.02 MB/s pillow-5.1.0-p 17% |##### | Time: 0:00:00 28.56 MB/s pillow-5.1.0-p 19% |###### | Time: 0:00:00 29.99 MB/s pillow-5.1.0-p 21% |###### | Time: 0:00:00 31.20 MB/s pillow-5.1.0-p 22% |####### | Time: 0:00:00 32.42 MB/s pillow-5.1.0-p 24% |####### | Time: 0:00:00 33.59 MB/s pillow-5.1.0-p 25% |######## | Time: 0:00:00 34.69 MB/s pillow-5.1.0-p 27% |######## | Time: 0:00:00 35.72 MB/s pillow-5.1.0-p 29% |######### | Time: 0:00:00 36.69 MB/s pillow-5.1.0-p 30% |######### | Time: 0:00:00 37.60 MB/s pillow-5.1.0-p 32% |########## | Time: 0:00:00 38.46 MB/s pillow-5.1.0-p 33% |########## | Time: 0:00:00 39.28 MB/s pillow-5.1.0-p 35% |########### | Time: 0:00:00 40.15 MB/s pillow-5.1.0-p 37% |########### | Time: 0:00:00 40.95 MB/s pillow-5.1.0-p 38% |############ | Time: 0:00:00 41.67 MB/s pillow-5.1.0-p 40% |############ | Time: 0:00:00 42.29 MB/s pillow-5.1.0-p 42% |############# | Time: 0:00:00 42.92 MB/s pillow-5.1.0-p 43% |############# | Time: 0:00:00 43.53 MB/s pillow-5.1.0-p 45% |############## | Time: 0:00:00 44.13 MB/s pillow-5.1.0-p 46% |############## | Time: 0:00:00 44.66 MB/s pillow-5.1.0-p 48% |############### | Time: 0:00:00 45.02 MB/s pillow-5.1.0-p 50% |############### | Time: 0:00:00 45.50 MB/s pillow-5.1.0-p 51% |################ | Time: 0:00:00 45.97 MB/s pillow-5.1.0-p 53% |################ | Time: 0:00:00 46.41 MB/s pillow-5.1.0-p 54% |################# | Time: 0:00:00 46.74 MB/s pillow-5.1.0-p 56% |################# | Time: 0:00:00 47.18 MB/s pillow-5.1.0-p 58% |################## | Time: 0:00:00 7.42 MB/s pillow-5.1.0-p 59% |################## | Time: 0:00:00 7.60 MB/s pillow-5.1.0-p 61% |################### | Time: 0:00:00 7.78 MB/s pillow-5.1.0-p 63% |################### | Time: 0:00:00 7.96 MB/s pillow-5.1.0-p 64% |#################### | Time: 0:00:00 8.14 MB/s pillow-5.1.0-p 66% |#################### | Time: 0:00:00 8.32 MB/s pillow-5.1.0-p 67% |##################### | Time: 0:00:00 8.49 MB/s pillow-5.1.0-p 69% |##################### | Time: 0:00:00 8.66 MB/s pillow-5.1.0-p 71% |###################### | Time: 0:00:00 8.74 MB/s pillow-5.1.0-p 72% |###################### | Time: 0:00:00 8.79 MB/s pillow-5.1.0-p 74% |####################### | Time: 0:00:00 8.96 MB/s pillow-5.1.0-p 75% |####################### | Time: 0:00:00 9.12 MB/s pillow-5.1.0-p 77% |######################## | Time: 0:00:00 9.29 MB/s pillow-5.1.0-p 79% |######################## | Time: 0:00:00 9.46 MB/s pillow-5.1.0-p 80% |######################### | Time: 0:00:00 9.63 MB/s pillow-5.1.0-p 82% |######################### | Time: 0:00:00 9.79 MB/s pillow-5.1.0-p 84% |########################## | Time: 0:00:00 9.96 MB/s pillow-5.1.0-p 85% |########################## | Time: 0:00:00 10.12 MB/s pillow-5.1.0-p 87% |########################### | Time: 0:00:00 10.29 MB/s pillow-5.1.0-p 88% |########################### | Time: 0:00:00 10.45 MB/s pillow-5.1.0-p 90% |############################ | Time: 0:00:00 10.61 MB/s pillow-5.1.0-p 92% |############################ | Time: 0:00:00 10.77 MB/s pillow-5.1.0-p 93% |############################# | Time: 0:00:00 10.93 MB/s pillow-5.1.0-p 95% |############################# | Time: 0:00:00 11.09 MB/s pillow-5.1.0-p 97% |############################## | Time: 0:00:00 11.24 MB/s pillow-5.1.0-p 98% |############################## | Time: 0:00:00 11.40 MB/s pillow-5.1.0-p 100% |###############################| Time: 0:00:00 11.53 MB/s pillow-5.1.0-p 100% |###############################| Time: 0:00:00 11.51 MB/s pbr-4.0.3-py_0 0% | | ETA: --:--:-- 0.00 B/s pbr-4.0.3-py_0 26% |######## | Time: 0:00:00 39.09 MB/s pbr-4.0.3-py_0 52% |################ | Time: 0:00:00 48.19 MB/s pbr-4.0.3-py_0 79% |######################## | Time: 0:00:00 52.85 MB/s pbr-4.0.3-py_0 100% |###############################| Time: 0:00:00 624.39 kB/s pbr-4.0.3-py_0 100% |###############################| Time: 0:00:00 623.03 kB/s mock-2.0.0-py3 0% | | ETA: --:--:-- 0.00 B/s mock-2.0.0-py3 15% |#### | Time: 0:00:00 37.65 MB/s mock-2.0.0-py3 31% |######### | Time: 0:00:00 46.48 MB/s mock-2.0.0-py3 46% |############## | Time: 0:00:00 46.28 MB/s mock-2.0.0-py3 62% |################### | Time: 0:00:00 48.44 MB/s mock-2.0.0-py3 77% |######################## | Time: 0:00:00 50.63 MB/s mock-2.0.0-py3 93% |############################ | Time: 0:00:00 51.25 MB/s mock-2.0.0-py3 100% |###############################| Time: 0:00:00 48.70 MB/s mock-2.0.0-py3 100% |###############################| Time: 0:00:00 45.07 MB/s [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:57:38.546234Z, end-time: 2018-06-01T02:57:40.653753Z, duration: 2, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/bin/pip install -U --cache-dir /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/.cache/pip recommonmark readthedocs-sphinx-ext Collecting recommonmark Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/df/a5/8ee4b84af7f997dfdba71254a88008cfc19c49df98983c9a4919e798f8ce/recommonmark-0.4.0-py2.py3-none-any.whl Collecting readthedocs-sphinx-ext Requirement already up-to-date: docutils>=0.11 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from recommonmark) Collecting commonmark<=0.5.4 (from recommonmark) Requirement already up-to-date: requests in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from readthedocs-sphinx-ext) Collecting nilsimsa>=0.3.7 (from readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: chardet<3.1.0,>=3.0.2 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: idna<2.7,>=2.5 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: urllib3<1.23,>=1.21.1 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Requirement already up-to-date: certifi>=2017.4.17 in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/python3.6/site-packages (from requests->readthedocs-sphinx-ext) Installing collected packages: commonmark, recommonmark, nilsimsa, readthedocs-sphinx-ext Successfully installed commonmark-0.5.4 nilsimsa-0.3.8 readthedocs-sphinx-ext-0.5.10 recommonmark-0.4.0 You are using pip version 9.0.3, however version 10.0.1 is available. You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command. [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:57:41.358089Z, end-time: 2018-06-01T02:57:41.436807Z, duration: 0, exit-code: 0 cat doc/source/conf.py #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- # # TileDB documentation build configuration file, created by # sphinx-quickstart on Mon Feb 5 10:08:37 2018. # # -- Imports configuration ------------------------------------------------- import os import subprocess import sys from os.path import abspath, join, dirname sys.path.insert(0, abspath(join(dirname(__file__)))) # -- ReadTheDocs configuration --------------------------------------------- # Special handling on ReadTheDocs builds. # Some of this code is from https://github.com/robotpy/robotpy-docs/blob/master/conf.py readthedocs = os.environ.get('READTHEDOCS', None) == 'True' rtd_version = os.environ.get('READTHEDOCS_VERSION', 'latest') rtd_version = rtd_version if rtd_version in ['stable', 'latest'] else 'stable' # On RTD, build the Doxygen XML files. if readthedocs: # Build docs subprocess.check_call(''' mkdir ../../build; cd ../../build; ../bootstrap; make doc; ''', shell=True) # -- General configuration ------------------------------------------------ # If your documentation needs a minimal Sphinx version, state it here. # # needs_sphinx = '1.0' # Add any Sphinx extension module names here, as strings. They can be # extensions coming with Sphinx (named 'sphinx.ext.*') or your custom # ones. extensions = [ 'sphinx.ext.autodoc', 'sphinx.ext.intersphinx', 'sphinxcontrib.contentui', 'breathe' ] if readthedocs: # Mapping for linking between RTD subprojects. intersphinx_mapping = { 'tiledb': ('https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/en/%s/' % rtd_version, None), 'tiledb-py': ('https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/%s/' % rtd_version, None) } # Add any paths that contain templates here, relative to this directory. templates_path = ['_templates'] # The suffix(es) of source filenames. source_suffix = '.rst' # The master toctree document. master_doc = 'index' # General information about the project. project = 'TileDB' copyright = '2018 TileDB, Inc' author = 'TileDB, Inc.' # The short X.Y version. version = '1.2' # The full version, including alpha/beta/rc tags. release = '1.2.0' # Breathe extension configuration. tiledb_dir = '../../' doxygen_xml_dir = tiledb_dir + 'build/xml/' breathe_projects = {'TileDB-C': doxygen_xml_dir, 'TileDB-C++': doxygen_xml_dir} breathe_default_project = 'TileDB-C' breathe_projects_source = { 'TileDB-C': (tiledb_dir + 'tiledb/sm/c_api/', ['tiledb.h']), 'TileDB-C++': (tiledb_dir + 'tiledb/sm/cpp_api/', ['tiledb']) } breathe_domain_by_file_pattern = { '*/c_api/tiledb.h': 'c', '*/cpp_api/tiledb': 'cpp' } # The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation # for a list of supported languages. # # This is also used if you do content translation via gettext catalogs. # Usually you set "language" from the command line for these cases. language = None # List of patterns, relative to source directory, that match files and # directories to ignore when looking for source files. # This patterns also effect to html_static_path and html_extra_path exclude_patterns = [] # The name of the Pygments (syntax highlighting) style to use. pygments_style = 'friendly' # If true, `todo` and `todoList` produce output, else they produce nothing. todo_include_todos = False # -- Options for HTML output ---------------------------------------------- html_static_path = ['_static'] html_logo = '_static/tileDB_uppercase_600_112.png' html_favicon = '_static/favicon.ico' if readthedocs: html_theme = 'default' else: import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] # -- Options for HTMLHelp output ------------------------------------------ # Output file base name for HTML help builder. htmlhelp_basename = 'TileDBdoc' # -- Options for LaTeX output --------------------------------------------- latex_elements = { # The paper size ('letterpaper' or 'a4paper'). # # 'papersize': 'letterpaper', # The font size ('10pt', '11pt' or '12pt'). # # 'pointsize': '10pt', # Additional stuff for the LaTeX preamble. # # 'preamble': '', # Latex figure (float) alignment # # 'figure_align': 'htbp', } # Grouping the document tree into LaTeX files. List of tuples # (source start file, target name, title, # author, documentclass [howto, manual, or own class]). latex_documents = [ (master_doc, 'TileDB.tex', 'TileDB Documentation', 'TileDB, Inc.', 'manual'), ] # -- Options for manual page output --------------------------------------- # One entry per manual page. List of tuples # (source start file, name, description, authors, manual section). man_pages = [ (master_doc, 'tiledb', 'TileDB Documentation', [author], 1) ] # -- Options for Texinfo output ------------------------------------------- # Grouping the document tree into Texinfo files. List of tuples # (source start file, target name, title, author, # dir menu entry, description, category) texinfo_documents = [ (master_doc, 'TileDB', 'TileDB Documentation', author, 'TileDB', 'One line description of project.', 'Miscellaneous'), ] # -- Custom Document processing ---------------------------------------------- # Generate the sidebar automatically so that it is identical across all subprojects. # This (and gensidebar.py) from https://github.com/robotpy/robotpy-docs import gensidebar gensidebar.generate_sidebar({'on_rtd': readthedocs, 'rtd_version': rtd_version}, 'tiledb') # -- Custom setup ----------------------------------------------------------- def setup(app): app.add_stylesheet('custom.css') ########################################################################### # auto-created readthedocs.org specific configuration # ########################################################################### # # The following code was added during an automated build on readthedocs.org # It is auto created and injected for every build. The result is based on the # conf.py.tmpl file found in the readthedocs.org codebase: # https://github.com/rtfd/readthedocs.org/blob/master/readthedocs/doc_builder/templates/doc_builder/conf.py.tmpl # import sys import os.path from six import string_types from sphinx import version_info # Get suffix for proper linking to GitHub # This is deprecated in Sphinx 1.3+, # as each page can have its own suffix if globals().get('source_suffix', False): if isinstance(source_suffix, string_types): SUFFIX = source_suffix else: SUFFIX = source_suffix[0] else: SUFFIX = '.rst' # Add RTD Static Path. Add to the end because it overwrites previous files. if not 'html_static_path' in globals(): html_static_path = [] if os.path.exists('_static'): html_static_path.append('_static') html_static_path.append('/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static') # Add RTD Theme only if they aren't overriding it already using_rtd_theme = False if 'html_theme' in globals(): if html_theme in ['default']: # Allow people to bail with a hack of having an html_style if not 'html_style' in globals(): import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_style = None html_theme_options = {} if 'html_theme_path' in globals(): html_theme_path.append(sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()) else: html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] using_rtd_theme = True else: import sphinx_rtd_theme html_theme = 'sphinx_rtd_theme' html_style = None html_theme_options = {} if 'html_theme_path' in globals(): html_theme_path.append(sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()) else: html_theme_path = [sphinx_rtd_theme.get_html_theme_path()] using_rtd_theme = True if globals().get('websupport2_base_url', False): websupport2_base_url = 'https://readthedocs.com/websupport' if 'http' not in settings.MEDIA_URL: websupport2_static_url = 'https://media.readthedocs.com/' else: websupport2_static_url = 'https://media.readthedocs.com/media//static' #Add project information to the template context. context = { 'using_theme': using_rtd_theme, 'html_theme': html_theme, 'current_version': "latest", 'version_slug': "latest", 'MEDIA_URL': "https://media.readthedocs.com/media/", 'PRODUCTION_DOMAIN': "readthedocs.com", 'versions': [ ("latest", "/en/latest/"), ("stable", "/en/stable/"), ], 'downloads': [ ("pdf", "//readthedocs.com/projects/tiledb-inc-tiledb/downloads/pdf/latest/"), ("htmlzip", "//readthedocs.com/projects/tiledb-inc-tiledb/downloads/htmlzip/latest/"), ("epub", "//readthedocs.com/projects/tiledb-inc-tiledb/downloads/epub/latest/"), ], 'subprojects': [ ("tiledb-inc-tiledb-py", "https://docs.tiledb.io/projects/tiledb-py/en/stable/"), ], 'slug': 'tiledb-inc-tiledb', 'name': u'TileDB', 'rtd_language': u'en', 'programming_language': u'words', 'canonical_url': 'https://docs.tiledb.io/en/stable/', 'analytics_code': '', 'single_version': False, 'conf_py_path': '/doc/source/', 'api_host': 'https://readthedocs.com', 'github_user': 'TileDB-Inc', 'github_repo': 'TileDB', 'github_version': 'dev', 'display_github': True, 'bitbucket_user': 'None', 'bitbucket_repo': 'None', 'bitbucket_version': 'dev', 'display_bitbucket': False, 'gitlab_user': 'None', 'gitlab_repo': 'None', 'gitlab_version': 'dev', 'display_gitlab': False, 'READTHEDOCS': True, 'using_theme': (html_theme == "default"), 'new_theme': (html_theme == "sphinx_rtd_theme"), 'source_suffix': SUFFIX, 'user_analytics_code': '', 'global_analytics_code': 'UA-17997319-2', 'commit': '7c256a26', } if 'html_context' in globals(): html_context.update(context) else: html_context = context # Add custom RTD extension if 'extensions' in globals(): # Insert at the beginning because it can interfere # with other extensions. # See https://github.com/rtfd/readthedocs.org/pull/4054 extensions.insert(0, "readthedocs_ext.readthedocs") else: extensions = ["readthedocs_ext.readthedocs"] [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:57:41.508198Z, end-time: 2018-06-01T02:57:59.359844Z, duration: 17, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/bin/sphinx-build -T -E -b readthedocs -d _build/doctrees-readthedocs -D language=en . _build/html Running Sphinx v1.7.4 -- The C compiler identification is GNU 5.4.0 -- The CXX compiler identification is GNU 5.4.0 -- Check for working C compiler: /usr/bin/gcc -- Check for working C compiler: /usr/bin/gcc -- works -- Detecting C compiler ABI info -- Detecting C compiler ABI info - done -- Detecting C compile features -- Detecting C compile features - done -- Check for working CXX compiler: /usr/bin/g++ -- Check for working CXX compiler: /usr/bin/g++ -- works -- Detecting CXX compiler ABI info -- Detecting CXX compiler ABI info - done -- Detecting CXX compile features -- Detecting CXX compile features - done -- Starting TileDB superbuild. -- Found Blosc: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/libblosc.so -- Found Bzip2: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/libbz2.so -- searching for catch in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/build/externals/src -- Could NOT find Catch (missing: CATCH_INCLUDE_DIR) -- Adding Catch as an external project -- Found LZ4: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/liblz4.so -- Could NOT find Spdlog (missing: SPDLOG_INCLUDE_DIR) -- Adding Spdlog as an external project -- Found Zlib: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libz.so -- Found Zstd: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/lib/libzstd.so -- Found OpenSSL: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libssl.so /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcrypto.so -- Could NOT find TBB (missing: TBB_LIBRARIES TBB_INCLUDE_DIR) -- Adding TBB as an external project -- Not found clang-tidy -- Not found clang-format -- Found Doxygen: /usr/bin/doxygen (found version "1.8.11") found components: doxygen dot -- Install prefix is /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/dist -- Configuring done -- Generating done -- Build files have been written to: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/build bootstrap success. Run "make" to build, "make check" to test, or "make -C tiledb install" to install. Scanning dependencies of target doc [ 50%] Preparing for Doxygen documentation [100%] Generating API documentation with Doxygen [100%] Built target doc loading translations [en]... done making output directory... loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/en/latest/objects.inv... loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv... WARNING: failed to reach any of the inventories with the following issues: WARNING: intersphinx inventory 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv' not fetchable due to : ('intersphinx inventory %r not fetchable due to %s: %s', 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv', , HTTPError(...)) building [mo]: targets for 0 po files that are out of date building [readthedocs]: targets for 30 source files that are out of date updating environment: 30 added, 0 changed, 0 removed reading sources... [ 3%] c++-api reading sources... [ 6%] c-api reading sources... [ 10%] index reading sources... [ 13%] installation reading sources... [ 16%] introduction reading sources... [ 20%] s3 reading sources... [ 23%] tiledb101/asynchronous-io reading sources... [ 26%] tiledb101/basic-concepts reading sources... [ 30%] tiledb101/compression reading sources... [ 33%] tiledb101/concurrency reading sources... [ 36%] tiledb101/consistency reading sources... [ 40%] tiledb101/consolidation reading sources... [ 43%] tiledb101/data-model reading sources... [ 46%] tiledb101/key-value-store reading sources... [ 50%] tiledb101/language-bindings reading sources... [ 53%] tiledb101/object-management reading sources... [ 56%] tiledb101/physical-organization reading sources... [ 60%] tiledb101/reading/handling-incomplete-queries reading sources... [ 63%] tiledb101/reading/index reading sources... [ 66%] tiledb101/reading/reading-dense-arrays reading sources... [ 70%] tiledb101/reading/reading-sparse-arrays reading sources... [ 73%] tiledb101/reading/utility-functions reading sources... [ 76%] tiledb101/storage-backends reading sources... [ 80%] tiledb101/system-architecture reading sources... [ 83%] tiledb101/updating reading sources... [ 86%] tiledb101/virtual-filesystem reading sources... [ 90%] tiledb101/writing/index reading sources... [ 93%] tiledb101/writing/writing-dense-data reading sources... [ 96%] tiledb101/writing/writing-sparse-data reading sources... [100%] usage /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/doc/source/c++-api.rst:78: WARNING: Duplicate declaration. /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/doc/source/c-api.rst:354: WARNING: doxygenfunction: Cannot find function "tiledb_kv_iter_finalize" in doxygen xml output for project "TileDB-C++" from directory: ../../build/xml/ looking for now-outdated files... none found pickling environment... done checking consistency... done preparing documents... done writing output... [ 3%] c++-api writing output... [ 6%] c-api writing output... [ 10%] index writing output... [ 13%] installation writing output... [ 16%] introduction writing output... [ 20%] s3 writing output... [ 23%] tiledb101/asynchronous-io writing output... [ 26%] tiledb101/basic-concepts writing output... [ 30%] tiledb101/compression writing output... [ 33%] tiledb101/concurrency writing output... [ 36%] tiledb101/consistency writing output... [ 40%] tiledb101/consolidation writing output... [ 43%] tiledb101/data-model writing output... [ 46%] tiledb101/key-value-store writing output... [ 50%] tiledb101/language-bindings writing output... [ 53%] tiledb101/object-management writing output... [ 56%] tiledb101/physical-organization writing output... [ 60%] tiledb101/reading/handling-incomplete-queries writing output... [ 63%] tiledb101/reading/index writing output... [ 66%] tiledb101/reading/reading-dense-arrays writing output... [ 70%] tiledb101/reading/reading-sparse-arrays writing output... [ 73%] tiledb101/reading/utility-functions writing output... [ 76%] tiledb101/storage-backends writing output... [ 80%] tiledb101/system-architecture writing output... [ 83%] tiledb101/updating writing output... [ 86%] tiledb101/virtual-filesystem writing output... [ 90%] tiledb101/writing/index writing output... [ 93%] tiledb101/writing/writing-dense-data writing output... [ 96%] tiledb101/writing/writing-sparse-data writing output... [100%] usage generating indices... genindex writing additional pages... search copying images... [ 4%] tiledb101/Figure_22.png copying images... [ 8%] tiledb101/Figure_2.png copying images... [ 12%] tiledb101/Figure_3.png copying images... [ 16%] tiledb101/Figure_4.png copying images... [ 20%] tiledb101/Figure_25.png copying images... [ 24%] tiledb101/Figure_15.png copying images... [ 28%] tiledb101/Figure_1.png copying images... [ 32%] tiledb101/Figure_23.png copying images... [ 36%] tiledb101/Figure_6.png copying images... [ 40%] tiledb101/Figure_7.png copying images... [ 44%] tiledb101/reading/Figure_20.png copying images... [ 48%] tiledb101/reading/Figure_16.png copying images... [ 52%] tiledb101/reading/Figure_17.png copying images... [ 56%] tiledb101/reading/Figure_18.png copying images... [ 60%] tiledb101/reading/Figure_19.png copying images... [ 64%] tiledb101/reading/Figure_21.png copying images... [ 68%] tiledb101/Figure_5.png copying images... [ 72%] tiledb101/Figure_13.png copying images... [ 76%] tiledb101/Figure_14.png copying images... [ 80%] tiledb101/vfs.png copying images... [ 84%] tiledb101/writing/Figure_8.png copying images... [ 88%] tiledb101/writing/Figure_9.png copying images... [ 92%] tiledb101/writing/Figure_10.png copying images... [ 96%] tiledb101/writing/Figure_11.png copying images... [100%] tiledb101/writing/Figure_12.png copying static files... WARNING: html_static_path entry '/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static' does not exist done copying readthedocs static files... done copying searchtools... done copying extra files... done dumping search index in English (code: en) ... done dumping object inventory... done build succeeded, 5 warnings. The HTML pages are in _build/html. Copying contentui stylesheet/javascript... done [rtd-command-info] start-time: 2018-06-01T02:57:59.499225Z, end-time: 2018-06-01T02:58:14.430592Z, duration: 14, exit-code: 0 python /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/conda/latest/bin/sphinx-build -T -b json -d _build/doctrees-json -D language=en . _build/json Running Sphinx v1.7.4 mkdir: cannot create directory ‘../../build’: File exists -- Starting TileDB superbuild. -- searching for catch in /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/build/externals/src -- Could NOT find Catch (missing: CATCH_INCLUDE_DIR) -- Adding Catch as an external project -- Could NOT find Spdlog (missing: SPDLOG_INCLUDE_DIR) -- Adding Spdlog as an external project -- Found Zlib: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libz.so -- Found OpenSSL: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libssl.so /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcrypto.so -- Could NOT find TBB (missing: TBB_LIBRARIES TBB_INCLUDE_DIR) -- Adding TBB as an external project -- Not found clang-tidy -- Not found clang-format -- Install prefix is /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/dist -- Configuring done -- Generating done -- Build files have been written to: /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/build bootstrap success. Run "make" to build, "make check" to test, or "make -C tiledb install" to install. [ 50%] Generating API documentation with Doxygen [100%] Built target doc loading translations [en]... done making output directory... loading pickled environment... done loading intersphinx inventory from https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv... WARNING: failed to reach any of the inventories with the following issues: WARNING: intersphinx inventory 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv' not fetchable due to : ('intersphinx inventory %r not fetchable due to %s: %s', 'https://tiledb-inc-tiledb.readthedocs-hosted.com/projects/python-api/en/latest/objects.inv', , HTTPError(...)) building [mo]: targets for 0 po files that are out of date building [json]: targets for 30 source files that are out of date updating environment: [extensions changed] 30 added, 2 changed, 0 removed reading sources... [ 3%] c++-api reading sources... [ 6%] c-api reading sources... [ 10%] index reading sources... [ 13%] installation reading sources... [ 16%] introduction reading sources... [ 20%] s3 reading sources... [ 23%] tiledb101/asynchronous-io reading sources... [ 26%] tiledb101/basic-concepts reading sources... [ 30%] tiledb101/compression reading sources... [ 33%] tiledb101/concurrency reading sources... [ 36%] tiledb101/consistency reading sources... [ 40%] tiledb101/consolidation reading sources... [ 43%] tiledb101/data-model reading sources... [ 46%] tiledb101/key-value-store reading sources... [ 50%] tiledb101/language-bindings reading sources... [ 53%] tiledb101/object-management reading sources... [ 56%] tiledb101/physical-organization reading sources... [ 60%] tiledb101/reading/handling-incomplete-queries reading sources... [ 63%] tiledb101/reading/index reading sources... [ 66%] tiledb101/reading/reading-dense-arrays reading sources... 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[100%] usage /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/doc/source/c++-api.rst:78: WARNING: Duplicate declaration. /home/docs/checkouts/readthedocs.org/user_builds/tiledb-inc-tiledb/checkouts/latest/doc/source/c-api.rst:354: WARNING: doxygenfunction: Cannot find function "tiledb_kv_iter_finalize" in doxygen xml output for project "TileDB-C++" from directory: ../../build/xml/ looking for now-outdated files... none found pickling environment... done checking consistency... done preparing documents... done writing output... [ 3%] c++-api writing output... [ 6%] c-api writing output... [ 10%] index writing output... [ 13%] installation writing output... [ 16%] introduction writing output... [ 20%] s3 writing output... [ 23%] tiledb101/asynchronous-io writing output... [ 26%] tiledb101/basic-concepts writing output... [ 30%] tiledb101/compression writing output... [ 33%] tiledb101/concurrency writing output... [ 36%] tiledb101/consistency writing output... [ 40%] tiledb101/consolidation writing output... [ 43%] tiledb101/data-model writing output... [ 46%] tiledb101/key-value-store writing output... [ 50%] tiledb101/language-bindings writing output... [ 53%] tiledb101/object-management writing output... [ 56%] tiledb101/physical-organization writing output... [ 60%] tiledb101/reading/handling-incomplete-queries writing output... [ 63%] tiledb101/reading/index writing output... [ 66%] tiledb101/reading/reading-dense-arrays writing output... [ 70%] tiledb101/reading/reading-sparse-arrays writing output... [ 73%] tiledb101/reading/utility-functions writing output... [ 76%] tiledb101/storage-backends writing output... [ 80%] tiledb101/system-architecture writing output... [ 83%] tiledb101/updating writing output... [ 86%] tiledb101/virtual-filesystem writing output... [ 90%] tiledb101/writing/index writing output... [ 93%] tiledb101/writing/writing-dense-data writing output... [ 96%] tiledb101/writing/writing-sparse-data writing output... [100%] usage generating indices... genindex writing additional pages... search copying images... [ 4%] tiledb101/Figure_22.png copying images... [ 8%] tiledb101/Figure_2.png copying images... [ 12%] tiledb101/Figure_3.png copying images... [ 16%] tiledb101/Figure_4.png copying images... [ 20%] tiledb101/Figure_25.png copying images... [ 24%] tiledb101/Figure_15.png copying images... [ 28%] tiledb101/Figure_1.png copying images... [ 32%] tiledb101/Figure_23.png copying images... [ 36%] tiledb101/Figure_6.png copying images... [ 40%] tiledb101/Figure_7.png copying images... [ 44%] tiledb101/reading/Figure_20.png copying images... [ 48%] tiledb101/reading/Figure_16.png copying images... [ 52%] tiledb101/reading/Figure_17.png copying images... [ 56%] tiledb101/reading/Figure_18.png copying images... [ 60%] tiledb101/reading/Figure_19.png copying images... [ 64%] tiledb101/reading/Figure_21.png copying images... [ 68%] tiledb101/Figure_5.png copying images... [ 72%] tiledb101/Figure_13.png copying images... [ 76%] tiledb101/Figure_14.png copying images... [ 80%] tiledb101/vfs.png copying images... [ 84%] tiledb101/writing/Figure_8.png copying images... [ 88%] tiledb101/writing/Figure_9.png copying images... [ 92%] tiledb101/writing/Figure_10.png copying images... [ 96%] tiledb101/writing/Figure_11.png copying images... [100%] tiledb101/writing/Figure_12.png copying static files... WARNING: html_static_path entry '/home/docs/checkouts/readthedocs.org/readthedocs/templates/sphinx/_static' does not exist done copying extra files... done dumping search index in English (code: en) ... done dumping object inventory... done build succeeded, 5 warnings. You can now process the JSON files in _build/json.